Sihtasutus Tartu Pauluse Kirik on asutatud Tartu linna ning EELK Tartu Pauluse koguduse poolt 22.12.2005 Tartu Pauluse kiriku renoveerimiseks, kasutamiseks ning säilitamiseks.

Juba 2006. aastal korraldas sihtasutus Tartu Pauluse Kiriku projekteerijate leidmiseks arhitektuurikonkursi ning 2007. aastal alustatigi nii arhitektuurse kui eriosade projekteerimisega.

2008. alustati kiriku etapiliste ehitustöödega – süvendati vundament, ehitati krüpt, rekonstrueeriti tiibhoone ning ehitati kolumbaarium. 2012. aastal sai EASi projekti toel alguse kirikuhoone renoveerimine ning haljastustegevused toimuvad 2015. aasta kevadsuvel. 

Sihtasutus veab ka Tartu Pauluse kiriku turundamist ja turundusmaterjalide väljaandmist.